为了使三效降膜蒸发器能保持平稳的运行，并获得良好的使用效果，设备中的控制系统起到了重要的作用。控制系统中包含的内容也比较多，除了对一些重要参数的控制之外，其他方面也不能忽视了，因此蒸发器中还有一些是属于辅助控制系统。
　　一种是液位控制装置，主要是控制三效降膜蒸发器中液位的高低，避免因过高或过低带来的不好影响。另一种是加热蒸汽的控制，防止其出现较大的波动，使得蒸汽机的压力、温度、液位等有所影响。
　　还有一种是冷凝液排出的控制，这部分如果没有做好的话，很容易因不通畅而影响三效降膜蒸发器的稳定性。因此，可以采用阻汽排水器，为了防止将蒸汽排掉，还可以在其中加一个缓冲罐，实现自动控制。
　　此外，还有节能控制，可以帮助三效降膜蒸发器实现节能效果。以上这些虽说都是辅助控制系统，但并不是可有可无的，对蒸发器操作的平稳、节能以及产品质量都有重要影响。